Auteur Sujet: Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie (Lu 1196250 fois)

Thornhill · « **Réponse #8628 le:** 02 janvier 2022 à 20:12:49 »

Citation de: alain_p le 02 janvier 2022 à 19:35:50

Je remarque une chose, c'est que les tests génétiques sont mis au même niveau que les tests PCR, comme les autotests. Il vaudra mieux avoir des autotests. J'en ai trouvé aujourd'hui, après avoir vu deux magasins (pharmacie et hypermarché) qui étaient en rupture de stock.

Coquille => antigénique.
Et pourtant, les spécialistes nous disent qu'en terme de fiabilité des tests on a la hiérarchie suivante :
PCR nasopharyngé > PCR salivaire >>> Antigénique nasopharyngé (pharmacie) > Antigénique nasal (autotest).

Et qu'un autotest devient positif plus tard que le PCR (de l'ordre de J8/J14).

Bref, le protocole cas contact devient une vraie passoire.

A propos de tests, un préprint publié en Afrique du Sud conclue que sur le variant Omicron, un prélèvement salivaire contient plus de charge virale qu'un prélèvement nasal, alors que sur les variants précédents c'était l'inverse.

Plusieurs études in vitro, et in vivo (sur modèle animal) sont également sorties et semblent indiquer que Omicron est d'avantage actif sur les cellules en voies hautes qu'en voies basses, ce qui rejoindrait plusieurs constatations :
- moindre risque de lésions pulmonaires donc moins de risques de réanimation
- plus grande contagiosité

alain_p · « **Réponse #8629 le:** 02 janvier 2022 à 20:17:46 »

Oui, coquille, antigénique.

En ce qui concerne le taux d'incidence, selon Geodes, on est ce soir à 1500 en France, et près de 2500 en Ile de France, avec les données au 30/12.

underground78 · « **Réponse #8630 le:** 02 janvier 2022 à 20:26:59 »

Citation de: Thornhill le 02 janvier 2022 à 20:12:49

Et pourtant, les spécialistes nous disent qu'en terme de fiabilité des tests on a la hiérarchie suivante :
PCR nasopharyngé > PCR salivaire >>> Antigénique nasopharyngé (pharmacie) > Antigénique nasal (autotest).

Et qu'un autotest devient positif plus tard que le PCR (de l'ordre de J8/J14).

On a des nouvelles de l'alerte de la FDA sur la fiabilité des tests antigéniques face à Omicron ?

Nico · « **Réponse #8631 le:** 02 janvier 2022 à 20:27:37 »

Citation de: underground78 le 02 janvier 2022 à 20:26:59

On a des nouvelles de l'alerte de la FDA sur la fiabilité des tests antigéniques face à Omicron ?

A part les UK qui disent le contraire des US, j'ai trop rien lu

.

Thornhill · « **Réponse #8632 le:** 02 janvier 2022 à 20:38:08 »

Le preprint sur les tests salivaires vs nasaux pour Omicron (prélèvements analysés par PCR attention, on juge la pertinence du prélèvement et pas le réactif) :

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.12.22.21268246v1?s=09

Ils utilisent des écouvillons salivaires (donc pas un recueil de salive en crachant dans un tube).

La proportion de test positifs sur les prélèvements, comparés à un standard, était respectivement de :
- 71% (salivaires) vs 100% (nasaux) pour le variant Delta
- 100% (salivaires) vs 86% (nasaux) pour le variant Omicron

Ces résultats suggèrent que le schéma d'excrétion virale au cours de l'infection est modifié pour Omicron.
L'infection est modifiée pour Omicron, avec une excrétion virale plus élevée dans la salive par rapport aux échantillons nasaux, ce qui permet d'améliorer les performances diagnostiques par des écouvillons salivaires. Cela confirme la constatation ex-vivo d'une meilleure réplication virale dans les tissus des voies respiratoires supérieures et d'une éventuelle modification du tropisme tissulaire.
Le diagnostic à l'aide d'écouvillons de la muqueuse nasale ou nasopharyngée peuvent être sous-optimale pour la variante Omicron.

Thornhill · « **Réponse #8633 le:** 02 janvier 2022 à 20:40:51 »

C'est pas jojo la vague Omicron au Danemark

alain_p · « **Réponse #8634 le:** 02 janvier 2022 à 20:45:37 »

Citation de: alain_p le 02 janvier 2022 à 20:17:46

En ce qui concerne le taux d'incidence, selon Geodes, on est ce soir à 1500 en France, et près de 2500 en Ile de France, avec les données au 30/12.

Nicolas Berrod, sur Twitter, après correction jour férié où tout est fermé, l'estime même à 1637 pour la France.

https://twitter.com/nicolasberrod/status/1477664549612531714

underground78 · « **Réponse #8635 le:** 02 janvier 2022 à 20:46:10 »

Citation de: Thornhill le 02 janvier 2022 à 20:40:51

C'est pas jojo la vague Omicron au Danemark

On voit quand même bien l'effet de la vaccination et possiblement de la moindre dangerosité d'Omicron, il y a beaucoup plus de cas pour un même nombre d'admissions à l'hôpital et c'est encore plus marqué pour les admissions en réa et les décès.

alain_p · « **Réponse #8636 le:** 02 janvier 2022 à 20:58:48 »

Sans compter que les admissions en hôpital, ou en soins intensifs, ne sont pas forcément dues au Omicron, mais aussi au Delta, qui était dominant il y a 15 jours, et qui vu les taux d'incidence atteints, même avec un faible pourcentage, représente un nombre de cas très conséquents. Par exemple, en France, avec 75% d'Omicron, et 25% de Delta, on a, si on retient 200.000 cas par jour, encore ~50.000 cas de Delta.

C'est aussi pour cela qu'il faut avoir des chiffres fiables sur l'évolution des pourcentage de variants en France, et sur le variant dont est atteint les personnes hospitaliées. J'espère qu'on les aura finalement demain soir ?

alain_p · « **Réponse #8637 le:** 02 janvier 2022 à 21:35:52 »

Selon Olivier Véran au JDD, c'est le Delta qui est responsable de la montée actuelle des hospitalisations et des réanimations :

Citer

"La vague Delta est responsable aujourd'hui de la montée des hospitalisations en réanimation", dit Olivier Véran au JDD.

La situation en Paca est éclairante. Delta y est encore largement majoritaire, et les admissions en soins critiques sont à un niveau record.

P.S Aussi :

Citer

Nous aurions pu espérer un effet de compétition entre les deux variants, qu'Omicron remplace Delta, mais ce n'est pas le cas. Les deux vagues se cumulent pour former une lame de fond. Nous aurions pu espérer un effet de compétition entre les deux variants, qu'Omicron remplace Delta, mais ce n'est pas le cas. Les deux vagues se cumulent pour former une lame de fond. C'est pour cela que nous avons encore besoin de mesures comme le port du masque, la limitation des rassemblements, le télétravail. Pour freiner Delta.

https://twitter.com/nicolasberrod/status/1477644083212566529
https://www.lejdd.fr/Politique/le-ministre-de-la-sante-olivier-veran-au-jdd-la-cinquieme-vague-de-covid-19-est-peut-etre-la-derniere-4085600

Jojo78 · « **Réponse #8638 le:** 03 janvier 2022 à 08:26:57 »

On devrait en savoir un peu plus concernant les hospitalisations/réa de Omicron en France d'ici peu en prenant en compte le décalage infection/hospitalisation.

spectrolazer · « **Réponse #8639 le:** 03 janvier 2022 à 18:23:11 »

Citation de: spectrolazer le 29 décembre 2021 à 10:58:47

Ce qui peut être intéressant à considérer c'est qu'ils sont jumeaux, donc génétiquement très similaires, ayant vraisemblablement contracté le même variant, non vaccinés mais *et j'en suis heureux*, pas été touchés de la même façon par le virus.
Maintenant gémellité ne veut pas dire que Grishka n'avait pas un facteur aggravant ou une comorbidité "acquis".

Finalement,....