Auteur Sujet: Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie  (Lu 1195573 fois)

0 Membres et 2 Invités sur ce sujet

Aerendil

  • Abonné Orange Fibre
  • *
  • Messages: 354
  • Cormeilles-en-Parisis 95
Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #2628 le: 27 mai 2020 à 09:23:30 »
Je ne sais pas où ça en est, mais je rappellerai qu'il était question fin mars que les anti-infalammatoires soient un facteur de risque chez les patients COVID+. Bizarrement on n'a pas entendu des levées de bouclier alors que franchement quoi de plus banal que l'ibuprofène ?


Si tu ne le sais pas, l'ibuprofène est tout sauf banal. Demande à ceux qui ont la varicelle et qui ont pris de l'ibuprofène ;)
Même le paracétamol devient dangereux....

Steph

  • Abonné K-Net
  • *
  • Messages: 7 663
  • La Balme de Sillingy 74
    • Uptime K-net
Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #2629 le: 27 mai 2020 à 09:46:51 »
Si tu ne le sais pas, l'ibuprofène est tout sauf banal. Demande à ceux qui ont la varicelle et qui ont pris de l'ibuprofène ;)
Même le paracétamol devient dangereux....
Ce sont des médicaments devenus "de confort" et dont les effets sont néfastes car empêchant le corps de faire son boulot correctement.
Je fête mes 10 ans d'abstinences d'automédication de ces saletés...  8)

underground78

  • Expert
  • Abonné Free fibre
  • *
  • Messages: 7 437
  • Orsay (91)
    • FreePON : suivi géographique du déploiement fibre EPON chez Free
Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #2630 le: 27 mai 2020 à 10:05:58 »
Euh... en général le problème c'est que les gens ne respectent pas les doses maximales indiquées...

Steph

  • Abonné K-Net
  • *
  • Messages: 7 663
  • La Balme de Sillingy 74
    • Uptime K-net
Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #2631 le: 27 mai 2020 à 10:23:27 »
Euh... en général le problème c'est que les gens ne respectent pas les doses maximales indiquées...
Aussi, mais pas seulement.


Nico

  • Modérateur
  • *
  • Messages: 44 490
  • FTTH 1000/500 sur Paris 15ème (75)
    • @_GaLaK_
Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #2632 le: 27 mai 2020 à 12:12:20 »
Demande à ceux qui ont la varicelle et qui ont pris de l'ibuprofène ;)
C'est exactement le sujet, ça n'est pas parce qu'un médicament est adapté au traitement d'une maladie, qu'il est sans risque pour toutes les maladies. C'est un des arguments de la #TeamRaoult en faveur de l'HCQ.

Notons que le décret concernant la (non-)prescription d'HCQ en France a été publié ce jour.

alain_p

  • Abonné Free fibre
  • *
  • Messages: 16 290
  • Delta S 10G-EPON sur Les Ulis (91)
Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #2633 le: 28 mai 2020 à 14:30:06 »
Voici les derniers graphiques de John Burn-Murdoch, concernant l'évolution du nombre de décès à l'hôpital, moyennés sur 7 jours, ici pour l'Europe. On voit que le nombre de décès continue à diminuer nettement, sauf en Suède, où la baisse est plus lente.

alain_p

  • Abonné Free fibre
  • *
  • Messages: 16 290
  • Delta S 10G-EPON sur Les Ulis (91)
Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #2634 le: 28 mai 2020 à 14:33:47 »
Pour l'Amérique du Sud, et l'Afrique du Sud, c'est au contraire en hausse. Pour l'Australie (et aussi la Nouvelle Zélande), cela reste très bas, mais ces deux pays sont des îles, avec un transport aérien toujours pratiquement à l'arrêt, donc peu de chances d'importer des cas de l'extérieur), et en plus ce sont des pays plus tempérés (en tout cas le sud de l'Australie), où l'on est chez eux l'équivalent de fin Novembre.

alain_p

  • Abonné Free fibre
  • *
  • Messages: 16 290
  • Delta S 10G-EPON sur Les Ulis (91)
Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #2635 le: 29 mai 2020 à 13:36:21 »
Concernant l'étude publiée par le Lancet vendredi dernier, une centaine de chercheurs du monde entier ont publié aujourd'hui une lettre ouverte demandant la transparence sur les données et codes utilisés, en particulier l'accès à la base de données utilisée, et s'interrogeant sur certaines incohérences des données publiées :
Citer
...
1. There was inadequate adjustment for known and measured confounders (disease severity, temporal effects, site effects, dose used).

2. The authors have not adhered to standard practices in the machine learning and statistics community. They have not released their code or data. There is no data/code sharing and availability statement in the paper. The Lancet was among the many signatories on the Wellcome statement on data sharing for COVID-19 studies.

3. There was no ethics review.

4. There was no mention of the countries or hospitals that contributed to the data source and no acknowledgments to their contributions. A request to the authors for information on the contributing centres was denied.

5. Data from Australia are not compatible with government reports (too many cases for just five hospitals, more in-hospital deaths than had occurred in the entire country during the study period). Surgisphere (the data company) have since stated this was an error of classification of one hospital from Asia. This indicates the need for further error checking throughout the database.

6. Data from Africa indicate that nearly 25% of all COVID-19 cases and 40% of all deaths in the continent occurred in Surgisphere-associated hospitals which had sophisticated electronic patient data recording, and patient monitoring able to detect and record “nonsustained [at least 6 secs] or sustained ventricular tachycardia or ventricular fibrillation”. Both the numbers of cases and deaths, and the detailed data collection, seem unlikely.

7. Unusually small reported variances in baseline variables, interventions and outcomes between continents (Table S3).

8. Mean daily doses of hydroxychloroquine that are 100 mg higher than FDA recommendations, whereas 66% of the data are from North American hospitals.

9. Implausible ratios of chloroquine to hydroxychloroquine use in some continents

10. The tight 95% confidence intervals reported for the hazard ratios are unlikely. For instance, for the Australian data this would need about double the numbers of recorded deaths as were reported in the paper.
...

https://zenodo.org/record/3862789#.XtChacA682z
https://www.lemonde.fr/sciences/article/2020/05/29/covid-19-l-etude-du-lancet-sur-l-hydroxychloroquine-suscite-des-interrogations_6041138_1650684.html

A suivre...
« Modifié: 29 mai 2020 à 15:28:47 par alain_p »

Steph

  • Abonné K-Net
  • *
  • Messages: 7 663
  • La Balme de Sillingy 74
    • Uptime K-net
Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #2636 le: 29 mai 2020 à 14:38:11 »
C'est quand même un sacré feuilleton!  8)
Prochaine série Netflix?

Thornhill

  • Abonné SFR fibre FttH
  • *
  • Messages: 3 976
  • Saint-Médard-en-Jalles (33)
Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #2637 le: 29 mai 2020 à 19:31:33 »
Les auteurs ont apporté une réponse, ils corrigent quelques erreurs dans les tableaux publiés en annexe mais ne changent pas leurs conclusions.
https://www.thelancet.com/lancet/article/s0140-6736(20)31249-6
https://marlin-prod.literatumonline.com/pb-assets/Lancet/pdfs/S0140673620311806-appendix.pdf

alain_p

  • Abonné Free fibre
  • *
  • Messages: 16 290
  • Delta S 10G-EPON sur Les Ulis (91)
Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #2638 le: 29 mai 2020 à 19:46:48 »
Ce qui fait penser qu'il pourrait y avoir d'autres erreurs dans leurs données, et qu'il faudrait un contrôle indépendant. Or leurs données sont inaccessibles.

Comme l'indique un chercheur de l'Université Columbia :
Citer
We emailed them to ask for the data, in particular to look at the dose effect which I think is key in understanding the results. They got back to us very quickly and said

    Thanks for your email inquiry. Our data sharing agreements with the various governments, countries and hospitals do not allow us to share data unfortunately
...
So unavailable data from unknown origins . . ..

Car la liste des hôpitaux ayant fourni les données n'est pas non plus disponible. (et pas de remerciement pour les avoir procurées).

https://statmodeling.stat.columbia.edu/2020/05/25/hydroxychloroquine-update/

Dans un autre post précédent, il dit que le taux de mortalité n'est pas crédible, car aurait été vu dans d'autres études, ce que j'avais déjà dit :

Citer
The big finding is that when controlling for age, sex, race, co-morbidities and disease severity, the mortality is double in the HCQ/CQ groups (16-24% versus 9% in controls). This is a huge effect size! Not many drugs are that good at killing people.

This caught my eye, as an effect size that big should have been picked up pretty quickly in the interim analyses of randomized trials that are currently happening. For example, the RECOVERY trial has a hydroxychloroquine arm and they have probably enrolled ~1500 patients into that arm (~10,000 + total already). They will have had multiple interim analyses so far and the trial hasn’t been stopped yet.

The most obvious confounder is disease severity: this is a drug that is not recommended in Europe and the USA, so doctors give it as “compassionate use”. I.e. very sick patient, so why not try just in case. Therefore the disease severity of the patients in the HCQ/CQ groups will be greater than the controls. The authors say that they adjust for disease severity but actually they use just two binary variables: oxygen saturation and qSOFA score. The second one has actually been reported to be quite bad for stratifying disease severity in COVID. The biggest problem is that they include patients who received HCQ/CQ treatment up to 48 hours post admission. This means that someone who comes in OKish and then deteriorates rapidly could be much more likely to get given the drug as compared to someone as bad but stable. This temporal aspect cannot be picked up a single severity measurement.

In short, seeing such huge effects really suggests that some very big confounders have not been properly adjusted for. What’s interesting is that the New England Journal of Medicine published a very similar study a few weeks ago where they saw no effect on mortality. Guess what, they had much more detailed data on patient severity.

One thing that the authors of the Lancet paper didn’t do, which they could have done: If HCQ/CQ is killing people, you would expect a dose (mg/kg) effect. There is very large variation in the doses that the hospitals are giving (e.g. for CQ the mean daily dose is 750 but standard deviation is 300). Our group has already shown that in chloroquine self-poisoning, death is highly predictable from dose (we used stan btw, very useful!). No dose effect would suggest it’s mostly confounding.

In short, it’s a pretty poor dataset and the results, if interpreted literally, could massively damage ongoing randomized trials of HCQ/CQ.

https://statmodeling.stat.columbia.edu/2020/05/24/doubts-about-that-article-claiming-that-hydroxychloroquine-chloroquine-is-killing-people/

vivien

  • Administrateur
  • *
  • Messages: 47 254
    • Twitter LaFibre.info
Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #2639 le: 30 mai 2020 à 13:59:41 »
Selon le centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC), l'Europe doit se préparer à une deuxième vague du nouveau coronavirus. La question n'est pas de savoir s'il y aura une nouvelle vague de contaminations, mais "quand et de quelle ampleur"

Statistiques sur la pandémie de Coronavirus COVID-19, rapportées au nombre d'habitants par pays, mis à jour toutes les semaines, le samedi matin.


Si on rapport au nombre d'habitant voici les pays qui ont eu le plus de décès dans la semaine :
- N°1 : Suède : 41 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°2 : Brésil : 33 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°3 : Royaume-uni : 26 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°4 : États-Unis : 21 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°5 : Canada : 19 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°6 : Belgique : 19 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°7 : Équateur : 16 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°8 : Irlande : 10,8 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°9 : Espagne : 10,5 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°10 : Italie : 10,1 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°11 : Portugal : 9,1 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°12 : Pays-Bas : 8,1 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°13 : France : 6,6 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°14 : Allemagne : 2,9 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°15 : Suisse : 1,9 décès / million d'habitants les 7 derniers jours
- N°16 : Luxembourg : 1,6 décès / million d'habitants les 7 derniers jours

Page N°1/6 du PDF : Graphique pour la France et indicateurs sur le nombre d'admission en réanimation.

(cliquez sur l’image pour zoomer, le tableau est difficilement lisible sans zoom)




Page N°2/6 du PDF : Statistiques sur le « top 8 » des régions Françaises.
(cliquez sur les graphiques pour zoomer)




Page N°3/6 du PDF : Nombre de décès par semaine, rapporté par million d'habitants.





Page N°4/6 du PDF : Statistiques sur la mobilité moyenne en voiture, à pied et en transport.





Tableaux :

Page N°5/6 du PDF : Tableau comparatif des pays 1/2.

(cliquez sur le tableau pour zoomer, le tableau est difficilement lisible sans zoom)


Page N°6/6 du PDF : Tableau comparatif des pays 2/2.
(cliquez sur le tableau pour zoomer, le tableau est difficilement lisible sans zoom)


Lien vers la version PDF de la semaine : 202005_statistiques_covid-19_30mai2020.pdf

Lien permanent vers la version PDF (mis à jour toutes les semaines, le samedi matin) : statistiques_covid-19.pdf

Lien permanent vers le fichier source :
(fichier LibreOffice Calc, lisible avec Microsoft Excel) :
statistiques_covid-19.ods