Auteur Sujet: Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie (Lu 1199249 fois)

alain_p · « **Réponse #8508 le:** 22 décembre 2021 à 20:04:00 »

Une étude Sud-Africaine, avec des données préliminaires, donne 80% de probabilité de moins d'être hospitalisé avec Omicron par rapport au Delta :

Citer

Covid in SA: People infected with Omicron have an 80% lower risk of hospitalisation, early data shows

Zakiyah Ebrahim

- People infected with Omicron are less likely to end up in the hospital, according to a preliminary analysis by scientists in SA.
- All current data is pointing to a consistent picture of a reduction in severity with Omicron in South Africa, says one of the study's authors.
- It is not yet clear whether this is as a result of Omicron being less virulent, or due to South Africa's high levels of immunity.

Covid-19 data in South Africa is increasingly pointing to the Omicron variant causing less severe illness than earlier variants, researchers at the National Institute for Communicable Diseases (NICD) said on Wednesday.

"Compellingly, together our data suggests a positive story of a reduced severity of Omicron compared to other variants," said Professor Cheryl Cohen, the head of the NICD's Centre for Respiratory Diseases and Meningitis.

Cohen and her colleagues conducted an early assessment of the severity of Omicron infection in the country.

Their findings were posted online to the preprint server medRxiv on Tuesday.

https://www.news24.com/health24/medical/infectious-diseases/coronavirus/covid-in-sa-people-infected-with-omicron-have-an-80-lower-risk-of-hospitalisation-early-data-shows-20211222
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.12.21.21268116v1

Thornhill · « **Réponse #8509 le:** 22 décembre 2021 à 20:25:19 »

L'Imperial College de Londres a publié une estimation de 15% de réduction sur le risque d'admission à l’hôpital et 40% sur le risque d'hospitalisation, pour la vague Omicron, comparée à la vague Delta.
Elle estime aussi le risque d'hospitalisation est réduit de 50% dans le cas d'une réinfection, par rapport à une primo-infection.

https://www.imperial.ac.uk/news/232882/some-reduction-hospitalisation-omicron-delta-england/?utm_source=twitter&utm_medium=social&utm_content=7484e010-cd3f-42a8-976f-cc43c7df3e51&utm_campaign=news

https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/covid-19/report-50-severity-omicron/

alain_p · « **Réponse #8510 le:** 22 décembre 2021 à 23:04:56 »

Ce soir, 84000 cas positifs, on se rapproche des records anglais, et 3147 patients en réanimation. On peut penser qu'il y a beaucoup d'Omicron là-dedans, mais je n'ai pas encore vu de résultat de criblage.

Thornhill · « **Réponse #8511 le:** 22 décembre 2021 à 23:27:46 »

Citation de: alain_p le 22 décembre 2021 à 23:04:56

Ce soir, 84000 cas positifs, on se rapproche des records anglais, et 3147 patients en réanimation. On peut penser qu'il y a beaucoup d'Omicron là-dedans, mais je n'ai pas encore vu de résultat de criblage.

Les résultats de criblage sur les 3 mutations d'intérêt pré-Omicron sont publiées tous les jours :

https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-de-laboratoires-pour-le-depistage-indicateurs-sur-les-mutations/

Il n'y a pas vraiment de suspens étant donné qu'avant Omicron, Delta représentait la quasi totalité des tests et que le criblage fait jusqu'ici sur 3 mutations d'intérêt permet déjà de savoir quand ce n'est pas Delta (échec de L452R = pas du Delta = très certainement Omicron). On déduisait donc que c'était Omicron par élimination de la possibilité que ce soit Delta.

Le nouveau kit de test permettra simplement de s'en assurer via détection d'une mutation spécifique Omicron (LK417N) et d'avoir le résultat plus rapidement.

Les criblages actuels laissent peu de doute :

alain_p · « **Réponse #8512 le:** 23 décembre 2021 à 08:27:41 »

Citation de: Thornhill le 22 décembre 2021 à 23:27:46

Les résultats de criblage sur les 3 mutations d'intérêt pré-Omicron sont publiées tous les jours :

Mais là, ton graphique s'arrête au 18/12, alors que celles de lundi 20 devraient être disponibles s'il faut 36h pour faire le criblage.

Les cvs sont des données hebdomadaires, et qui s'arrêtent même au 13/12.

Une remarque, le nombre de cas positifs dénombrés est peut-être faussé par le fait qu'avant Noël beaucoup se font tester (850.000 tests quotidiens).

Thornhill · « **Réponse #8513 le:** 23 décembre 2021 à 09:47:30 »

Citation de: alain_p le 23 décembre 2021 à 08:27:41

Mais là, ton graphique s'arrête au 18/12, alors que celles de lundi 20 devraient être disponibles s'il faut 36h pour faire le criblage.

Les cvs sont des données hebdomadaires, et qui s'arrêtent même au 13/12.

Non, ce sont des données quotidiennes avec des valeurs moyennées sur 7 jours glissants.
Par exemple, pour Paris : dernière valeur du 13 au 19 décembre :

2021-12-11-2021-12-17
2021-12-12-2021-12-18
2021-12-13-2021-12-19

Avec la variation quotidienne de la moyenne il est possible d'estimer ("délissage") celle des derniers jours, ce que fait le graphique de @flodebarre.

Ce qui donne déjà une vision raisonnable de la situation des criblages quotidiens.

alain_p · « **Réponse #8514 le:** 23 décembre 2021 à 11:15:14 »

OK, donc apparemment dernières données lissées au 15/12, donc à priori dernières données disponibles au 22/12, mais sur le graphique au 18 ou 19/12, peut-être avant un changement de format de données pour les nouveaux gènes à rechercher pour le omicron ?

Thornhill · « **Réponse #8515 le:** 23 décembre 2021 à 15:11:52 »

Citation de: alain_p le 23 décembre 2021 à 11:15:14

OK, donc apparemment dernières données lissées au 15/12, donc à priori dernières données disponibles au 22/12, mais sur le graphique au 18 ou 19/12, peut-être avant un changement de format de données pour les nouveaux gènes à rechercher pour le omicron ?

Si tu regardes le jeu de données SIDEP pour les PCR, les dernières données publiées le 22/12 sont datées du 19/12, donc comme pour les données de criblage.

https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-relatives-aux-resultats-des-tests-virologiques-covid-19/

xp25 · « **Réponse #8516 le:** 24 décembre 2021 à 16:07:53 »

Bon, c'est pas parce qu'aujourd'hui c'est réveillon de Noël que le virus ne circule pas (bien au contraire) et les infos également.

Bonne nouvelle, le pass vaccinal devrait être assortit d'un test (négatif) obligatoire dans certains lieux (restaurants et bars notamment).

Il serait temps, depuis juillet

https://www.20minutes.fr/sante/3204791-20211224-coronavirus-gouvernement-pourrait-imposer-test-negatif-plus-pass-vaccinal-certains-lieux

Info en +, conseil de défense lundi : https://www.20minutes.fr/sante/3204735-20211224-coronavirus-direct-barre-100000-contaminations-bientot-atteinte-france

Je vous met la magnifique photo de l'article :

eruditus · « **Réponse #8517 le:** 24 décembre 2021 à 16:11:00 »

Tu passes de pourrait (de l’article) à devrait...tu prends trop tes désirs pour la réalité ou tu comptes continuer le topic encore longtemps ?

Steph · « **Réponse #8518 le:** 24 décembre 2021 à 16:15:11 »

Mais il y aurait encore des gens qui iraient dans les bars et les restaurants dans ces conditions?
Il y a vraiment des masochistes du contrôle...

Allez, petite chanson de Noël :

alain_p · « **Réponse #8519 le:** 24 décembre 2021 à 16:18:53 »

En tout cas, malgré la vague Omicron, le Reff a encore un peu baissé, à 1.08, sur une semaine, et une trenttaine de départements voient le nombre de cas et d'hospitalisation baisser. Certainement parce qu'ils ne sont pas encore touchés par la vague Omicron, et que celle Delta baisse.