Auteur Sujet: Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie (Lu 1199694 fois)

Pour toi qui semble connaître les labos ou qqn d'autre, un tests PCR si je comprends bien nécessite de cultiver un peu la matière.

Quel est le temps minimum pour pouvoir raisonnablement sortir un test positif ou négatif ?

alain_p · « **Réponse #3322 le:** 05 septembre 2020 à 14:54:43 »

J'ai lu justement qu'il y avait environ 23% de faux positifs dans les tests.

Sinon, j'avais lu aussi qu'il fallait compter 3 heures pour avoir me résultat d'un test PCR. Je pense que le temps n'est pas le seul facteur, il faut par exemple que l'échantillon n'ait pas été contaminé par un autre positif, que le prélèvement ait été bien fait etc...

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Eviter les résultats faussement positifs

La gestion journalière d'un grand nombre d'échantillons et la grande sensibilité de la technique PCR peuvent, en l'absence de précaution, générer des résultats faussement positifs par contamination. Il existe trois types de contamination :

- La contamination inter-échantillons pré-PCR, c'est-à-dire la contamination d'un échantillon négatif par un échantillon positif avant l'amplification PCR (lors du prélèvement, de l'échantillonnage, de l'extraction d'ADN).

- La contamination des réactifs ou des échantillons avec de l'ADN amplifié provenant d'amplifications précédentes.

- La contamination inter-échantillons post-PCR est possible lors de la détection des produits amplifiés. Un échantillon positif contient au moins 1010 molécules d'ADN par µl, il est donc important de bien faire attention lors des pipetages pour ne pas contaminer les tubes entre eux.

* Pour éviter ces problèmes de contamination, il faut veiller à la parfaite séparation des étapes de l'analyse PCR et des échantillons entre eux. Les manipulations pré-PCR et post-PCR devront donc être réalisées dans des pièces séparées.
...

https://www.gazettelabo.fr/archives/pratic/2000/50ADIAGENE.html

Thornhill · « **Réponse #3323 le:** 05 septembre 2020 à 15:10:49 »

Le souci des résultats de tests PCR menés actuellement est aussi qu'ils sont trop binaires et ne disent rien de la contagiosité : les amplifications successives font remonter positif le moindre brin d'ARN viral.
Certains spécialistes comme l'allemand Drosten souhaiteraient bénéficier plutôt d'une mesure de charge virale significative qui permettrait d'avoir une politique d'isolation plus ciblée sur les contaminateurs réels, ils sont aussi pour une isolation plus précoce mais plus courte, de l'ordre de 5 jours.
On sait désormais par exemple que l'intérêt d'isoler 14 jours après résultat du test les cas contacts asymptomatiques est discutable, car leur contagiosité réelle se situe dans les premiers jours et décroit très rapidement.

Bon, tout ceci n'est pas simple à organiser, évidemment on tâtonne.

https://inf-covid.blogspot.com/2020/08/rentree-scolaire-prise-de-position-de.html

Nous avons besoin de tests de contagiosité plutôt que d'infection

Mais si, dans la dynamique de la seconde vague, on trouvait une foule de clusters partout, n'imposerait-on pas à terme un confinement général? Ne devrait-on pas alors envoyer partout des gens en quarantaine? Et cela ne conduirait-il pas à des résistances?

Peut-être pas si vous utilisez la stratégie à bon escient. Tout d'abord: si vous regardez des données plus récentes sur l'excrétion du virus, l'isolement pendant 5 jours des membres d’un cluster est suffisant, et le week-end peut être compté. J'appellerais cette conjonction de quarantaine et d'isolement "temps d’affaiblissement" pour ne pas diluer la terminologie. À la fin de ces cinq jours (et pas avant), on teste les membres du cluster. Une telle règle unique pour les clusters est gérable et c'est toujours mieux qu'un confinement général.

En outre, nous avons besoin d'un changement crucial de notre stratégie: tester la contagiosité plutôt que l'infection. Les tests PCR courants fournissent déjà les informations au sujet de la charge virale. Une faible charge virale signifie qu'un patient n'est plus contagieux. Si nous osions définir un seuil pour la charge virale à partir des données scientifiques disponibles, les médecins pourraient alors immédiatement libérer les personnes placées en quarantaine se situant sous ce seuil. La plupart le seraient.