J'ai eu le même problème de gesillement sur des videos youtube après une écoute prolongé.
Avec les mêmes symptomes (manques de basses, on dirait que la connectique lache...)
J'étais sous ubuntu 16.04 a l'époque, ma solution était juste de laisser les écouteurs gésiller avec du son pendant 5 bonnes minutes, et le probème disparaissait.
J'ai jamais trouvé d'autres solutions..
Depuis 6 mois, je suis passé sous opensuse tumbleweed (donc avec un kernel plus récent, probablement aussi la version de pulseAudio) je n'ai pas rencontré ce problème depuis.
Si c'est dû a des correctifs dans le kernel ou dans pulsAudio, on peut espérer qu'ubuntu récupèrera ces correctifs prochainement