La ligne commande, c'est généralement la seule façon pas trop pénible de faire des traitements systématiques.
Mais la ligne de commande Unix est vraiment très, très, très mal foutue contrairement à la propagande des Unixiens, et la plupart des utilitaires utilisables en ligne de commande interagissent vraiment mal surtout dans les cas pathologiques, même si GNU a fait des progrès par rapport à Unix tradi. Les utilitaires comme grep, sed, awk... forment un patchwork délirant et totalement infect, mais qui génère des "gourous" qui ne sont plus capables de voir la débilité du truc, notamment du principe fondamental de combiner des commandes avec | (connexion de flux de caractères).
Pour désigner un seul objet et faire une opération simple dessus (ouvrir, renommer, supprimer), je ne vois pas mieux que de cliquer dessus.