Pour le débit IPv4, peut-être qu'ils ont mis un tunnel qui, volontairement ou non, ne permettrait pas une bonne détection de la MTU.
Je pense par exemple à un 4rd ne respecterait pas le flag IPv4 DF, ce qui ne permettrait pas de déterminer la MTU, et forcerait la Freebox à fragmenter chaque paquet IPv4 en deux paquets IPv6, et le routeur en face à réassembler.
Pour confirmer, on pourrait faire des tests de débit avec une MTU réduite à 1480, ou 1460.