Tes prises RJ45 ne sont actuellement pas des prises Ethernet, contrairement à ce que tu dis, mais de simples prises de téléphone au format RJ45.
Des prises de téléphone qui actuellement transportent un signal ADSL/VDSL.
Tu as bien compris ça?

Tu dis que le technicien fibre rendra inutilisable les 3 autres prises Ethernet, mais cette phrase n'a aucun sens. Le technicien ne touchera pas à tes prises RJ45, ça n'est pas son boulot.
Oui, l'ADSL/VDSL utilisait ces prises téléphone RJ45. Mais la fibre ne les utilisera pas.
Brancher une box via son port xDSL? Ou brancher via un port Ethernet?
 - via un port xDSL de la box, à la prise RJ45 : si tu conserves un abonnement xDSL, en plus de ton abonnement FTTH, alors tu continueras à bénéficier du xDSL. Tu auras 2 box qui fonctionneront par 2 moyens différent.
 - via un port Ethernet de la box, à la prise RJ45 : pour que ça donne quelque chose, il faudra changer l'installation, installer un bandeau de prises RJ45 au tableau électrique, et un switch Ethernet. Tu peux aussi vouloir juste mettre une jarretière RJ45, entre 2 prises de ton bandeau RJ45, juste pour faire une liaison Ethernet 1Gb/s entre bureau et salon, par exemple. Pas besoin de prise de courant supplémentaire au niveau du tableau électrique dans ce cas.

Leon.

ok d'accord, je comprends mieux. J'ai effectivement confondu "prise Ethernet" et "prise RJ45" par abus de langage. Je ne pensais même pas qu'on pouvais faire cohabiter un abonnement xDSL avec un abonnement fibre. Je pensais que ce dernier le remplaçait obligatoirement. C'est plus clair maintenant.

Comme quoi on en apprend tous les jours 

Il ne faut quand même pas sortir de Saint Cyr pour câbler une prise modulaire.
https://www.bis-electric.com/modulaire/appareil-de-commande/prise-electrique-tableau.html
 
@Ju_Lann
Il y a non seulement les 4 paires à câbler pour les prises RJ45 pour le réseau local, mais aussi vérifier que toutes les pièces sont bien reliées de façon indépendante au tableau. Présence de 3 ou 4 câbles?

Dans les anciennes installations tout était mis en parallèle et cela marchait tant qu'on n'utilise qu'une seule prise à la fois.

Non c'est juste moi qui ai confondu bêtement "port Ethernet" avec "prise en RJ45", par abus de langage. Du coup ça rendait mon questionnement un peu brouillon.

Sauf demande du proprio, ce qui m'étonnerait, je demanderais au technicien fibre d'aller au plus simple pour lui et pour la configuration du logement. Donc de préférence installer le PTO dans le bureau où est actuellement la box (si possible), ou bien dans le salon le cas échéant. Mais déjà il faut que j'attende l'éligibilité de mon logement à la fibre. Déjà plus de 4 mois que les boitiers PBO sont fixés en façade, il faut que je prenne mon mal en patience.

Quoiqu'il en soit, merci à tous pour vos réponses. J'ai appris pas mal de trucs