Auteur Sujet: Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie  (Lu 1189048 fois)

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Nico

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Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #3600 le: 17 septembre 2020 à 19:27:57 »
Jolie vague  ;)
Quand tu découvres qu'il y a des marées en Méditerranée...

spectrolazer

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Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #3601 le: 17 septembre 2020 à 20:56:32 »
En effet, très intéressant. J'avais lu un truc là dessus, mais ton article est mieux illustré.

Hélas, avant même de lire l'article, je me disais que faire croire à la fiabilité des maths pour des solutions impliquant la médecine et la politique, ce n'était pas gagné d'avance. En effet, le monde politique a l'habitude de croire qu'une loi ou un décret peu violer un théorème ou les loi de la physique, en parlant de croyance ou d'opinion  ::)
Du coup, que cela risquait de rejoindre le cimetière des bonnes idées du début de l'épidémie avec les masques en tissus non fiable ou les tests vétérinaires.

Cela n'a pas loupé, le Haut Conseil pour la santé a recommandé "niet", en se basant sur les inconvénients des vieilles méthodes. Mais vu que le temps a donné raison aux bonnes idées, éventuellement avec un renommage (masques en tissus devenant masques grand publique), on va garder espoir. Je propose même le nom de "AI Pooling"
De ce que j'ai compris c'est un refus également lié à l'éthique, le fait de mélanger les échantillons individuels.
Cela se paye également en temps de préparation/analyse supplémentaire pour les techniciens.

Thornhill

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Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #3602 le: 17 septembre 2020 à 21:43:09 »
Extrait de l'avis du HCSP du 11/08/2020 (ne tient pas compte du tapestry pooling, ils n’envisagent que le pooling standard, pour cibler par itérations) :

S’agissant du poolage des échantillons, le HCSP, après avoir actualisé la bibliographie considère qu’il n’y a aucun élément nouveau modifiant la recommandation de ne pas mettre en œuvre cette pratique depuis son avis du 10 mai 2020. Recommander cette pratique à l’heure de l’augmentation de la circulation du virus SARS CoV-2 serait au contraire de nature à allonger les délais de réponse des échantillons positifs avec un risque majoré de résultats rendus faussement négatifs du fait de la baisse de sensibilité par la technique de poolage des échantillons.

Thornhill

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Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #3603 le: 18 septembre 2020 à 00:12:36 »
Tests de séroprévalence effectuée en mai :

Johannol

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Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #3604 le: 18 septembre 2020 à 10:34:11 »
De ce que j'ai compris c'est un refus également lié à l'éthique, le fait de mélanger les échantillons individuels.

J'ai du mal à comprendre de quel raison éthiques on pourrait parler.

Cela se paye également en temps de préparation/analyse supplémentaire pour les techniciens.

Normalement, on gagne du temps justement, mais seulement une fois industrialisé la méthode.
C'est sûr que si les techniciens font ça en classeur Excel alors qu'aujourd'hui les notifications sont envoyés automatiquement, c'est pas gagné.

Thornhill

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Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #3605 le: 18 septembre 2020 à 16:57:39 »
Etude US sur la mesure de l'épidémie par analyse des eaux usées :

https://www.nature.com/articles/s41587-020-0684-z


All data represent the cities of New Haven, Hamden, East Haven and Woodbridge, Connecticut, which are served by the ESWPAF. The blue vertical dashed lines indicate the first week of analysis, March 19–25, 2020. a,b, Number of positive SARS-CoV-2 test results, reported by date of specimen collection. c,d, Percentage of positive SARS-CoV-2 test results, reported by date of specimen collection. e,f, Number of COVID-19 admissions to Yale New Haven Hospital for residents of the four cities. g,h, Number of positive SARS-CoV-2 test results by public reporting date. i,j, Primary sludge SARS-CoV-2 RNA concentration (virus RNA gene copies per ml of sludge).

Thornhill

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Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #3606 le: 18 septembre 2020 à 19:05:31 »
La HAS valide l'utilisation des prélèvements salivaires pour les tests PCR, uniquement pour les symptomatiques, et en priorité pour les jeunes enfants et personnes âgées.

A voir le gain réel en terme de files d'attentes, et ça n'améliorera pas les délais des résultats...


 

eruditus

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Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #3607 le: 18 septembre 2020 à 19:35:09 »
La HAS valide l'utilisation des prélèvements salivaires pour les tests PCR, uniquement pour les symptomatiques, et en priorité pour les jeunes enfants et personnes âgées.

A voir le gain réel en terme de files d'attentes, et ça n'améliorera pas les délais des résultats...

Si deja cela permet d'éviter effectivement des évictions injustifiés d'établissement scolaire et une détection plus rapide en ephad, c'est une bonne chose.

alain_p

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Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #3608 le: 18 septembre 2020 à 22:17:51 »
Pas mal de sites annoncent aujourd'hui 123 décès en 24h, mais ce sont en fait des statistiques faussées par le fait qu'un hôpital de l'Essonne a publié aujourd'hui 240 dossiers, dont 78 décès qui sont en fait des dossiers qui remontent à quelques mois. Cela fausse les statistiques de l'Essonne, de l'IdF, et même celles nationales. Il y a un avertissement sur le site Geodes.

Citer
123 personnes sont déclarées mortes du Covid-19 en France ces dernières 24 heures, portant le total à 31.249 victimes. Une forte hausse quotidienne de la mortalité qui est due à un établissement hospitalier de l'Essonne (91) qui a transmis ce vendredi près de «240 dossiers concernant des patients hospitalisés au cours des derniers mois». «De ce fait, les indicateurs hospitaliers du 18 septembre 2020 présentent une augmentation soudaine dans ce département. Cet impact est également visible à un niveau régional et national.» Ce rattrapage concerne 76 décès, ce qui explique l'augmentation du nombre de morts déclarés ce vendredi, selon Santé publique France.

https://www.lefigaro.fr/sciences/coronavirus-13-215-nouveaux-cas-en-24-heures-les-hospitalisations-augmentent-20200918
https://geodes.santepubliquefrance.fr/#c=home

spectrolazer

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Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #3609 le: 19 septembre 2020 à 00:51:13 »
Normalement, on gagne du temps justement, mais seulement une fois industrialisé la méthode.
C'est sûr que si les techniciens font ça en classeur Excel alors qu'aujourd'hui les notifications sont envoyés automatiquement, c'est pas gagné.
Non.
Le résultat est envoyé après analyse, les positifs sont très souvent contrôlés par les biologistes, les négatifs automatiquement envoyés .
Il y a une préparation / analyse supplémentaire  des courbes en fin de traitement, si tu pooles, donc du temps....

Steph

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Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #3610 le: 19 septembre 2020 à 09:36:09 »
Pas mal de sites annoncent aujourd'hui 123 décès en 24h, mais ce sont en fait des statistiques faussées par le fait qu'un hôpital de l'Essonne a publié aujourd'hui 240 dossiers, dont 78 décès qui sont en fait des dossiers qui remontent à quelques mois. Cela fausse les statistiques de l'Essonne, de l'IdF, et même celles nationales. Il y a un avertissement sur le site Geodes.
J'espère sincerement que le comptage des morts au jour le jour va se généraliser à ceux dus à :
 - Bagnole et assimilé
 - Vieillesse
 - Grippe
 - Crise cardiaque
 - AVC
 - Cancer
 - Connerie conjugale
etc...

Free_me

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Coronavirus Covid-19: Suivi de la pandémie
« Réponse #3611 le: 19 septembre 2020 à 22:18:55 »
pour payer encore plus de gens a gratter du papier ?